MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201

Total Repeats: 32071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020913	GAAAA	2	10	724	733	80 %	0 %	20 %	0 %	478482032
2	NC_020913	TCC	2	6	758	763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482032
3	NC_020913	CTT	2	6	787	792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482032
4	NC_020913	GAG	2	6	811	816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482032
5	NC_020913	CAT	3	9	864	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482032
6	NC_020913	ACA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482032
7	NC_020913	ATA	2	6	1030	1035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478482032
8	NC_020913	AAG	2	6	1048	1053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
9	NC_020913	CGA	2	6	1143	1148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482032
10	NC_020913	GATA	2	8	1149	1156	50 %	25 %	25 %	0 %	478482032
11	NC_020913	AAG	2	6	1165	1170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
12	NC_020913	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478482032
13	NC_020913	CAT	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482032
14	NC_020913	CAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482032
15	NC_020913	GAAGA	2	10	1309	1318	60 %	0 %	40 %	0 %	478482032
16	NC_020913	AAC	2	6	1343	1348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482032
17	NC_020913	GAA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
18	NC_020913	TCT	2	6	1473	1478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482032
19	NC_020913	AGA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482032
20	NC_020913	GTG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478482032
21	NC_020913	CTT	2	6	1640	1645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482032
22	NC_020913	AGGA	2	8	1812	1819	50 %	0 %	50 %	0 %	478482032
23	NC_020913	GAT	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482032
24	NC_020913	A	6	6	1915	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	478482032
25	NC_020913	GAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482032
26	NC_020913	TCT	2	6	2133	2138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482033
27	NC_020913	CT	3	6	2289	2294	0 %	50 %	0 %	50 %	478482033
28	NC_020913	A	6	6	2297	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	478482033
29	NC_020913	TCGCA	2	10	2349	2358	20 %	20 %	20 %	40 %	478482033
30	NC_020913	CGA	3	9	2371	2379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482033
31	NC_020913	AGAT	2	8	2433	2440	50 %	25 %	25 %	0 %	478482033
32	NC_020913	AGA	3	9	2487	2495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482033
33	NC_020913	CGAGG	2	10	2602	2611	20 %	0 %	60 %	20 %	478482033
34	NC_020913	TCGGT	2	10	2654	2663	0 %	40 %	40 %	20 %	478482034
35	NC_020913	CTT	2	6	2678	2683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482034
36	NC_020913	CCA	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482034
37	NC_020913	CAT	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482034
38	NC_020913	CAATGT	2	12	3020	3031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478482034
39	NC_020913	ATG	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482034
40	NC_020913	TGC	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482034
41	NC_020913	GGA	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482034
42	NC_020913	CCG	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482034
43	NC_020913	CGA	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482034
44	NC_020913	CTT	2	6	3476	3481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482034
45	NC_020913	CCG	2	6	3560	3565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482035
46	NC_020913	C	6	6	3683	3688	0 %	0 %	0 %	100 %	478482035
47	NC_020913	GAG	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482035
48	NC_020913	ACC	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482035
49	NC_020913	TCA	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482035
50	NC_020913	ACG	2	6	3914	3919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482035
51	NC_020913	GAC	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482035
52	NC_020913	ATCC	2	8	3945	3952	25 %	25 %	0 %	50 %	478482035
53	NC_020913	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482035
54	NC_020913	GAAG	2	8	4011	4018	50 %	0 %	50 %	0 %	478482035
55	NC_020913	ATT	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478482035
56	NC_020913	AG	3	6	4312	4317	50 %	0 %	50 %	0 %	478482036
57	NC_020913	CGC	2	6	4318	4323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482036
58	NC_020913	GAG	2	6	4376	4381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482036
59	NC_020913	CGC	2	6	4432	4437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482036
60	NC_020913	CTT	2	6	4500	4505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482036
61	NC_020913	GGA	2	6	4553	4558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
62	NC_020913	GATC	2	8	4598	4605	25 %	25 %	25 %	25 %	478482037
63	NC_020913	ACC	2	6	4608	4613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482037
64	NC_020913	CGA	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
65	NC_020913	GCT	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
66	NC_020913	AGA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
67	NC_020913	CCG	2	6	4729	4734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482037
68	NC_020913	AGA	2	6	4864	4869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
69	NC_020913	GAA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
70	NC_020913	TCG	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
71	NC_020913	CGA	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
72	NC_020913	TCT	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
73	NC_020913	AAGA	2	8	5010	5017	75 %	0 %	25 %	0 %	478482037
74	NC_020913	TCG	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
75	NC_020913	TCCT	2	8	5235	5242	0 %	50 %	0 %	50 %	478482037
76	NC_020913	CGA	2	6	5252	5257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
77	NC_020913	AAAG	2	8	5348	5355	75 %	0 %	25 %	0 %	478482037
78	NC_020913	GAC	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
79	NC_020913	GGAA	2	8	5427	5434	50 %	0 %	50 %	0 %	478482037
80	NC_020913	CGA	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
81	NC_020913	AAC	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482037
82	NC_020913	AGT	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482037
83	NC_020913	CGACC	2	10	5561	5570	20 %	0 %	20 %	60 %	478482037
84	NC_020913	TTC	2	6	5598	5603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
85	NC_020913	TCA	3	9	5641	5649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
86	NC_020913	TTC	2	6	5712	5717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
87	NC_020913	GGA	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
88	NC_020913	CTA	2	6	5750	5755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
89	NC_020913	CGG	2	6	5783	5788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482037
90	NC_020913	CGC	2	6	5798	5803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482037
91	NC_020913	GCC	2	6	5832	5837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482037
92	NC_020913	ACG	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482037
93	NC_020913	CCT	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482037
94	NC_020913	ACA	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482037
95	NC_020913	GGC	2	6	6045	6050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482037
96	NC_020913	GGA	2	6	6072	6077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
97	NC_020913	TCT	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
98	NC_020913	CTT	2	6	6089	6094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
99	NC_020913	TCA	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
100	NC_020913	TCG	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482037
101	NC_020913	ATC	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
102	NC_020913	GGC	2	6	6299	6304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482037
103	NC_020913	CAT	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
104	NC_020913	GAT	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482037
105	NC_020913	ATCT	2	8	6393	6400	25 %	50 %	0 %	25 %	478482037
106	NC_020913	ACT	2	6	6403	6408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
107	NC_020913	TCA	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482037
108	NC_020913	ATG	2	6	6531	6536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482037
109	NC_020913	TTC	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482037
110	NC_020913	GGA	3	9	6549	6557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482037
111	NC_020913	AAG	2	6	6558	6563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482037
112	NC_020913	A	7	7	6606	6612	100 %	0 %	0 %	0 %	478482037
113	NC_020913	TTGA	2	8	6632	6639	25 %	50 %	25 %	0 %	478482037
114	NC_020913	AGC	3	9	6754	6762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482038
115	NC_020913	GTC	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482038
116	NC_020913	CAA	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482039
117	NC_020913	AAG	2	6	7031	7036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
118	NC_020913	AAG	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
119	NC_020913	AAG	2	6	7111	7116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
120	NC_020913	AGA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
121	NC_020913	AGG	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482039
122	NC_020913	TC	4	8	7143	7150	0 %	50 %	0 %	50 %	478482039
123	NC_020913	TAC	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482039
124	NC_020913	TGG	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478482039
125	NC_020913	CAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482039
126	NC_020913	CAT	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482039
127	NC_020913	TCC	2	6	7336	7341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482039
128	NC_020913	TCC	2	6	7400	7405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482039
129	NC_020913	GAA	3	9	7457	7465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482039
130	NC_020913	ACT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482040
131	NC_020913	GAA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
132	NC_020913	CTC	2	6	7534	7539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482040
133	NC_020913	AGA	3	9	7542	7550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
134	NC_020913	ACA	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482040
135	NC_020913	ATG	2	6	7567	7572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482040
136	NC_020913	CTCG	2	8	7656	7663	0 %	25 %	25 %	50 %	478482040
137	NC_020913	GCA	2	6	7703	7708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
138	NC_020913	CTC	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482040
139	NC_020913	CAT	2	6	7788	7793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482040
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141	NC_020913	GAG	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482040
142	NC_020913	GGA	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482040
143	NC_020913	GAA	2	6	7926	7931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
144	NC_020913	TCG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
145	NC_020913	CGA	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
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147	NC_020913	TAC	2	6	8020	8025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482040
148	NC_020913	CTG	2	6	8032	8037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
149	NC_020913	GAA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
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151	NC_020913	CGA	2	6	8196	8201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
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153	NC_020913	GCC	2	6	8242	8247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482040
154	NC_020913	GCA	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482040
155	NC_020913	CGT	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
156	NC_020913	CAA	2	6	8337	8342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482040
157	NC_020913	CAA	2	6	8361	8366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482040
158	NC_020913	CGT	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
159	NC_020913	GAA	2	6	8493	8498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482040
160	NC_020913	CTG	2	6	8500	8505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482040
161	NC_020913	CGA	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482041
162	NC_020913	A	6	6	8611	8616	100 %	0 %	0 %	0 %	478482041
163	NC_020913	TCCA	2	8	8715	8722	25 %	25 %	0 %	50 %	478482041
164	NC_020913	CGT	3	9	8726	8734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482041
165	NC_020913	AAG	2	6	8775	8780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482041
166	NC_020913	ATGA	3	12	8812	8823	50 %	25 %	25 %	0 %	478482041
167	NC_020913	TC	3	6	8878	8883	0 %	50 %	0 %	50 %	478482042
168	NC_020913	TCA	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482042
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171	NC_020913	ACG	2	6	9070	9075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478482042
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173	NC_020913	CGT	2	6	9218	9223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482042
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239	NC_020913	CAA	2	6	12197	12202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478482044
240	NC_020913	CAT	2	6	12233	12238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482044
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242	NC_020913	TCCA	2	8	12270	12277	25 %	25 %	0 %	50 %	478482044
243	NC_020913	GAG	2	6	12330	12335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482044
244	NC_020913	CGC	2	6	12377	12382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478482044
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247	NC_020913	GCT	2	6	12407	12412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482044
248	NC_020913	ATC	2	6	12462	12467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482044
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250	NC_020913	ACC	2	6	12531	12536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478482044
251	NC_020913	AAG	2	6	12552	12557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482044
252	NC_020913	AGA	2	6	12601	12606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482045
253	NC_020913	TATGCT	2	12	12670	12681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478482045
254	NC_020913	TCA	2	6	12690	12695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482045
255	NC_020913	TTC	2	6	12889	12894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482046
256	NC_020913	ATG	2	6	12931	12936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478482046
257	NC_020913	TCT	2	6	12962	12967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482046
258	NC_020913	ATC	2	6	13003	13008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482046
259	NC_020913	ATCC	2	8	13023	13030	25 %	25 %	0 %	50 %	478482046
260	NC_020913	CCT	2	6	13073	13078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478482046
261	NC_020913	TCTT	2	8	13093	13100	0 %	75 %	0 %	25 %	478482046
262	NC_020913	TCG	2	6	13219	13224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482046
263	NC_020913	CAT	2	6	13290	13295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482046
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265	NC_020913	GGGC	2	8	13334	13341	0 %	0 %	75 %	25 %	478482046
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269	NC_020913	TCG	2	6	13543	13548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482046
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291	NC_020913	GGAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	50 %	0 %	478482049
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293	NC_020913	AGA	2	6	14936	14941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478482049
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386	NC_020913	CGT	2	6	19336	19341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478482054
387	NC_020913	GGC	2	6	19495	19500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482054
388	NC_020913	AGTC	2	8	19504	19511	25 %	25 %	25 %	25 %	478482054
389	NC_020913	TCAT	2	8	19518	19525	25 %	50 %	0 %	25 %	478482054
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391	NC_020913	GGC	2	6	19660	19665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478482055
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462	NC_020913	TTC	2	6	22293	22298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482057
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493	NC_020913	CAT	2	6	23830	23835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478482058
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497	NC_020913	CTT	2	6	24108	24113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478482059
498	NC_020913	TGCC	2	8	24157	24164	0 %	25 %	25 %	50 %	478482059
499	NC_020913	GGA	2	6	24217	24222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478482059
500	NC_020913	CGGC	2	8	24231	24238	0 %	0 %	50 %	50 %	478482059

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